感染病菌、子宫内膜异位症、人工流产等都是导致输卵管不育的原因，其中女性感染了衣原体和淋病奈瑟菌是导致输卵管不育的主要原因。多种原因导致输卵管不育，而输卵管不育带来较为明显的后果就是不孕。导致输卵管不育原因有以下三点：
1、传染性细菌：
（1）衣原体感染：衣原体感染是导致输卵管不孕的常见因素之一，国外研究发现，输卵管是衣原体感染的高发部位，病原体可以持续存在于输卵管上，从而导致输卵管损伤甚至闭塞，严重时导致不孕。
（2）淋病奈瑟菌的感染：淋病奈瑟氏菌的简称，可以引起性传播疾病，以泌尿生殖系统的化脓性感染为主要表现。淋病奈瑟菌进入女性生殖道后，很容易引起子宫颈淋球菌发炎。进一步上升会引起输卵管粘膜上皮细胞的损伤、坏死和脱落，导致输卵管形成疤痕和粘连失败，并导致输卵管的菌毛和周围粘连和闭锁影响精子和卵子相遇，阻碍受精，并导致不孕。
（3）结核菌感染：慢性腹痛和既往结核史也是导致输卵管不育的危险因素之一。存在不孕不育问题的女性中有15%存在生殖器结核的问题，而这些患者中输卵管结核又占的85%-95%。女性感染结核菌首先会出现肌层或黏膜下层，然后病菌会逐渐向黏膜及浆膜层蔓延，使得输卵管逐渐增大、管壁增厚，输卵管的表面出现多数粟粒样结节的病变，并粘连周围，导致发生输卵管粘连。
（4）其他病菌感染：女性在感染了化脓性葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌及绿脓杆菌等病菌之后，很容易导致间质性输卵管炎、峡部结节性输卵管炎、输卵管积水和输卵管积脓等问题，这些病菌在进一步发展之后会导致输卵管不育的问题。
2、子宫内膜异位症：
如果女性存在子宫内膜异位症的问题，就容易导致盆腔粘连、输卵管阻塞、闭塞或者蠕动减弱的问题，这种情况就会影响了摄取卵子和孕育卵子。其中大多数患者是出现了输卵管的峡部（即输卵管最细的部分）发生闭塞，逐渐形成输卵管不育。
3、人工流产：
人工流产虽然不会直接导致输卵管不育，但是女性在进行人工流产后，很容易出现盆腔炎等并发症，这种情况都可能会导致医源性输卵管不育发病率的上升。
