女性在出现假两性畸形的问题之后，不仅会出现身体上的畸形，还会会导致其他疾病。一般情况下女性假两性畸形患者会出现闭经，外阴发育异常，难辨性别，嗓音低沉，身材较矮，阴蒂肥大，阴唇融合，多毛等问题。存在女性假两性畸形的患儿的很有可能会出现继发性不孕不育、闭经等问题。
女性在出现假两性畸形的问题之后，是需要及时的进行治疗的。一般情况下，在治疗期间，需要在诊断明确后应根据患者原社会性别、本人愿望及畸形程度后再进行矫治。原则上无论是出现了那种情况的两性畸形，除阴茎发育良好者外，均以按女性抚养。常见的两性畸形治疗方法如下。
1.在诊断为先天性肾上腺增生后，应开始使用可的松药物并终身使用，以抑制垂体促肾上腺皮质激素的过度分泌，防止外阴进一步变生和骨早期闭合。它还可以促进女性生殖器官的发展，使月经来潮甚至怀孕和分娩的可能性增加；切除部分增大的阴蒂，只留下阴蒂龟头使其接近正常女性阴蒂的大小；外阴融合畸形者应进行手术矫正，以使尿道和阴道口分开暴露。
2.对于雄激素不敏感综合症，无论是完全性还是不完全性，建议根据女性进行哺育。完全型患者可以等待青春期发烧并清除两个睾丸以防止恶变，并在手术后长期服用雌激素以维持女性的第二性征。不完全型患者的外生殖器发生玻璃化畸形，应事先进行整形手术，并切除两个睾丸。阴道成形术对于阴道短而阻碍性生活的人是可行的。
3.其他混合性腺发育不良或单纯性腺发育不良的女性假性两性畸形型患者的染色体核型为XXY，其性腺的恶性转化频率更高，发生年龄可能很小，因此应在诊断后进行诊断。尽快去除未分化的性腺。
4.真正的两性畸形的性别的确定主要取决于外生殖器的功能状态。应去除不需要的性腺，并保留适合其性别的性腺。通常，除了阴茎较大，可以竖立，并具有可以推入阴囊的睾丸可以作为男性，否则最好还是以女性的身份。
